海门市属少数民族散杂居地区，少数民族人口甚少。1953年全市有2个少数民族，3人；1964年全市4个少数民族，9人；1982年在全国第三次人口普查时，全市有7个少数民族，43人。随着改革开放和市场经济的深入发展，我市与内地、边疆的交往也日益增多。海门优越的地理环境，较发达的经济文化和富裕的生活水平，吸引了不少内地和边远地区的女青年，其中不乏少数民族同胞。据2000年全国第五次人口普查统计，海门共有29个少数民族，1722人。其中人数最多的少数民族为苗族326人，其次是布依族277人，傣族177人，蒙古族174人，侗族156人。他们分别来自湖南、广西、贵州、吉林、青海、云南等10多个省市自治区，主要分布在我市22个乡镇，其中90％分布在农村。他们大多数是从一些欠发达地区婚嫁过来的。这些婚进少数民族妇女由于文化偏低、缺少技术、资金、信息等基本致富条件，加上各种复杂的原因，其生活状况与当地群众相比差距较大。据调查掌握，我市处在贫困线以下的少数民族家庭有160多户，其中年人均收入在2000元以下的贫困户家庭78户。随着海门经济的快速发展，来我市的少数民族流动人员也明显增多。据统计，目前在我市经商、务工的少数民族人员有1800多人，主要分布在海门、三星两个镇。

　　海门是天主教海门教区原主教公署的所在地，曾管辖崇明、南通、如皋、靖江、泰兴等市，在国内外颇有一定影响。海门又是全省宗教工作重点县市和全省18个天主教工作重点县市之一，我市现有天主教、基督教、佛教三种宗教，其中天主教有信众6000多人，基督教有信众3000多人，佛教因没有明显的入教仪式，故未作统计。目前，经市政府批准、登记的宗教活动场所共21处，其中天主教5处，基督教9处，佛教7处。现有宗教教职人员67人，其中天主教9人，基督教2人，佛教56人。有爱国宗教团体3个：市天主教爱国会、市佛教协会、市基督教“三自”爱国会。